نازی‌ها این اتاق را در ژانویه سال ۱۹۴۱ و هنگام اشغال سن پترزبورگ توقیف کرده و با خود به کونیگزبرگ آلمان آوردند. از اینجاست که دیگر هیچ خبری از این اتاق شنیده نمی‌شود و شکارچیان گنج نسل‌ها برای پیدا کردن آن سعی و تلاش کرده اما به نتیجه نرسیده‌اند. با این که بسیاری تصور می‌کنند که این اتاق قربانی جنگ شده و از بین رفته است، «کارل هاینز کلاین» بازنشته‌ای ۶۸ می‌گوید که سرنخ جدیدی از مکان این اتاق دارد.
کلاین می‌گوید که یکی از افسران نازی به نام «اریش کوش» اتاق کهربایی را به شهر خود «ووپِرتال» منتقل کرده و ممکن است که این اتاق همچنان در این شهر در یک تونل زیرزمینی یا پناهگاهی پنهان مخفی باشد. اریش کوش محکوم به انجام جنایات جنگی شد و به جرم قاچاق و انتقال آثار هنری دزدیده شده از کونیگزبرگ در ماه‌های آخر جنگ شناخته شده بود.
اتاق کهربایی تنها یکی از بسیار گنجینه‌هاییست که در دوران جنگ جهانی دوم دزدیده شدند و حتی هم اکنون نیز بسیاری از این آثار با ارزش کشف شده و به صاحبان اصلیشان بازگردانده می‌شوند.
